Detail Cantuman Kembali
Profil Sekuen Internal Transcribed Spacer (ITS) Mangifera pedicellata Konterm. Vak XXIV.A.156 Koleksi Kebun Raya Bogor
- Bagikan:
Tumbuhan Mangifera pedicellata termasuk ke dalam genus Anacardiaceae. M. pedicellata berasal dari daerah Sulawesi. Tumbuhan ini dikonservasi di Kebun Raya Bogor (KRB). Penelitian molekuler tanaman M. pedicellata penting dilakukan karena belum ada yang melakukan penelitian mengenai molekuler DNA M. pedicellata berbasis ITS sehingga penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi profil sekuen ITS M. pedicellata dan kekerabatannya dengan speises lain yang berada di NCBI. Penelitian ini dilakukan pada bulan Januari- Desember 2024. Sampel M. pedicellata diambil dari koleksi Kebun Raya Bogor (KRB). Penelitian ini menggunakan metode CTAB dengan tahapan meliputi pengambilan sampel, ekstraksi DNA, proses PCR, elektroforesis, sekuensing, dan analisis data hasil sekuensing. Sekuen DNA gen ITS pada tumbuhan M. pedicellata mempunyai sekuen 900 bp dan menghasilkan pita DNA tunggal, serta mempunyai komposisi nukleotid T(U): 20,4%, C: 32,9%, A: 16,2%, G: 30,3%. Hasil BLAST menunjukkan homologi tertinggi pada M. quadrifida dengan nilai 96,64%. Analisis pohon filogenetik menggunakan metode Neighbor Joining dengan model kimura 2- parameter dan nilai boostrap 1000 ulangan menunjukkan bahwa M. pedicellata berkerabat dekat dengan M. quadrifida karena berada pada cabang yang sama dengan boostrap 83%. Jarak genetik M. pedicellata dengan M. quadrifida menunjukkan nilai terendah dengan nilai 0.035, sedangkan nilai jarak genetik tertinggi pada M. camptosperma yakni 1.218.
Arrifatuzzahroh - Personal Name
SKRIPSI BIO 056
583
Text
Indonesia
2025
serang
xvii + 51 hlm.; 18 x 25 cm
LOADING LIST...
LOADING LIST...