Detail Cantuman Kembali
DNA Barcoding Mangifera similis Blume VAK VII.E.211 Koleksi Kebun Raya Bogor Berbasis Internal Transcribed Spacer (ITS)
- Bagikan:
Indonesia merupakan negara yang memiliki laju deforestasi sekitar 2,83 juta per tahun. Terdapat 437 mengalami ancaman kepunahan salah satunya tanaman Anacardiaceae spesies Mangifera similis Blume yang dikembangkan di Kebun Raya Bogor. Mangifera similis merupakan tumbuhan yang dibudidayakan di Jawa. Nama lokal tanaman M. similis adalah keput pajuput. Penelitian untuk memperoleh hasil karakterisasi molekuler menggunakan sekuen Internal Transcribed Spacer (ITS) perlu dilakukan. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui karakteristik sekuen ITS dan menganalisis hubungan kekerabatan Mangifera similis Blume Vak VII.E.211 Koleksi Kebun Raya Bogor berdasarkan sekuen ITS. Penelitian dilakukan pada bulan Desember 2023-Januari 2025. Tahapan penelitian dilakukan terdiri dari pengambilan dan sortasi daun M. similis, preparasi sampel, ekstraksi DNA, amplifikasi DNA, elektroforesis dan pembuatan pohon filogenetik. Hasil penelitian menunjukkan karakterisasi M. similis sekuen ITS memiliki panjang 900 bp. Pohon filogenetik di analisis menggunakan metode Construct/ Test Neighbor Joining (NJ) menggunakan MEGA X. Pohon filogenetik yang mempunyai kekerabatan terdekat dengan M. similis yaitu spesies M. griffithii dengan nilai bootstrap 88% dan M. odorata memperoleh nilai bootstrap 100% keduanya berada di clade II. Hal tersebut disebabkan oleh garis percabangan yang sangat dekat. Perhitungan jarak genetik memiliki kekerabatan yang sangat erat pada spesies M. griffithii diperoleh jarak genetik 0,0245 dan nilai jarak genetik dengan kekerabatan jauh pada spesies Bouea oppositifolia yaitu 2,047. Hasil penjajaran dilakukan untuk mengetahui komposisi nukleotida pada M. similis dihasilkan T(U): 21,0, C: 32,1, A: 17,5, G: 29,2, total: 660.
Putri Apriani - Personal Name
SKRIPSI BIO 051
583
Text
Indonesia
2025
serang
xviii + 44 hlm.; 18 x 25 cm
LOADING LIST...
LOADING LIST...